ＳＩＳＴＥＲ１,０００,０００ シスターミリオン～百万人妹大逃亡！

少女分裂病。

原因不明のその病を発症した少女は、恐ろしい勢いで増殖を開始する。

増えた少女は不死身で狂暴。恐ろしい膂力で人を襲う。

対処方法は、増殖の元となったオリジナルの少女を殺すこと。ただそれだけ。

周十四郎（あまねじゅうしろう）は市役所の職員。

発症少女を殺害する専門部署『少女駆除課』の職員である。

そんな彼の元に、倉庫に住み着いている家出少女が発症しているという通報が入る。

いつも通り、発症少女の頭をぶち抜いて、それで終わり。

報告書を書いて、タイムカードを押して、それで終わり。

その筈だった。

その少女が、生き別れになっていた彼の妹でさえなければ。